저자 :2022-01-13보기 :2307

Nanjing University School of Medicine의 Nature Communications Paper는 단일 세포 염색질 MAP를 기반으로 비정상 신장 먹튀 링크 공급원을 성공적으로 추적합니다

종양 세포 및 섬유증 세포와 같은 질병 관련 먹튀 링크 세포 유형은 세포 운명 및 질병 표현형을 결정하는 데 중요한 요소입니다. 원산지 먹튀 링크 분자 특성은 끊임없이 변화하는 비정상 세포에서 유지 될 수있다. 따라서, 질병에서 비정상 먹튀 링크 세포 기원 및 분자 특성을 식별하는 것은 질병 발생 및 발달의 메커니즘을 더욱 이해하는 데 매우 중요한 역할을하며, 질병의 조기 진단을 수행하고 잠재적 치료 적 목표를 발견하는 효과적인 방법이다.

2022Year1Month10그 당시, Yang Jingping의 연구 그룹, Liu Zhihong의 연구 그룹 및 Nanjing University 의과 대학의 Guo Hongqian 연구 그룹Nature Communications매거진은 출판 기사 "신장의 단일 세포 염색질 접근성 환경은 이종 유두 신장 세포 암종에서 추가적인 원래 세포를 식별》》, 신장의 단일 세포 염색질 조경 맵을 구성하고 염색질 특징 인식 모델을 확립함으로써 신장 비정상 먹튀 링크 공급원 및 분자 특성의 추적 성을 실현합니다.

18098_18196Scatac) 단일 세포 해상도에서 수만 개의 게놈 영역에서 신호를 감지하고 세포 정체성에 대한 포괄적이고 상세한 후성 유전학지도를 제공합니다. 이 프로젝트의 연구자들은 오랫동안 후생의 관점에서 세포 운명 변형과 질병의 작용 메커니즘을 이해하기 위해 노력해 왔습니다. 팀은 초기 단계에서 신장을 최적화합니다​​Scatac-seq의 실험 프로토콜 및 생물 정보 분석 프로세스에 기초하여, 세포 유형-특이 적 후성 유전 학적 특성을 사용하여 비정상적인 먹튀 링크 기원을 추적하기위한 추적 전략이 처음으로 확인된다.

연구팀은 단일 세포 해상도에서 인간 신장 샘플에서 세포 유형 특이 적 염색질 접근성 환경을 포착했습니다. 엄격한 품질 관리 후 총9460매우 높은 품질의 핵 및 주석이 달린20신장의 모든 주요 세포 유형을 다루는 세포 클러스터는 신장에서 질병과 관련된 비정상적인 먹튀 링크 기원을 식별하기위한 완전한 기준 맵을 제공합니다. 이 참조 맵을 사용하여, 연구팀은 신장 유두암 먹튀 링크 기원 세포를 확인하고 원위 수집 튜브 세포에서 유래 된 희귀 한 비정상 돌연변이 그룹을 발견했습니다. 근위 세관으로부터 유래 된 이전의인지 샘플과 달리, 원위 수집 튜브로부터 유래 된 돌연변이 세포는 높은 수준의 악성 종양을 나타냈다.

흥미롭게도, 상이한 소스로부터의 돌연변이 된 세포는 식별 된 정밀 셀 소스와 비교하여 상이한 변환 경로를 보여준다. 근위 홀의 비정상적인 세포는노치andmTOR신호 전달 경로의 활성화, 원위 수집 튜브로부터 유래 된 돌연변이 세포는 염증 및 면역 관련 경로의 독특한 활성화를 나타낸다. 악성 신장 유두암 세포가 변형을 받고 있습니다mTOR활성화 증거의 부족은 또한VEGF-andmTOR가이드 요법 및 인터페론, 진행된 신장 유두암 환자의 작은 이점의 문제. 동시에, 팀의 연구 결과는 면역 체크 포인트 억제제가 그러한 변이체 환자에게 더 나은 임상 적 이점을 가져올 수 있다고 제안합니다.

이 연구는 단일 세포 염색질 접근성 특징 추적 성 방법을 처음으로 신장 종양 먹튀 링크 소스 이질성을 밝히고 세포 공급원 및 질병 병인에 기초한 임상 적 정확한 치료 계획의 추가 제형을위한 이론적 기초를 제공했다. 이 연구는 중국 국립 자연 과학 재단, 중국 장부 지방 자연 과학 재단 및 장부 지방 임상 의료 센터 혁신 플랫폼과 같은 프로젝트에 의해 자금을 지원 받았다. 양 징핑 (Yang Jingping) 부교수, 리우 중 하히 교수 및 난징 대학교 의과 대학의 구아 홍키 교수는 공동 대응 저자이며 난징 대학교 의과 대학의 박사 과정 학생들은 공동 작가입니다.

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그림1: 신장 유두암 먹튀 링크 기원과 변형의 도식 다이어그램.



논문 링크 :

https : //www.nature.com/articles/s41467-021-27660-3




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